Объяснимая ML-платформа для исследования риска прогрессирования рака

Исследовательская система для оценки риска прогрессирования и анализа ответа на терапию на горизонтах 3, 6 и 12 месяцев — на основе доступных клинических данных.

Запросить доступ
// исследование риска прогрессирования · анализ ответа на терапию · SHAP-факторы · неопределённость

Разрабатывается для работы с продольными клиническими данными

Платформа формирует временную шкалу пациента: диагноз, терапия, контрольные обследования, ответ и подтверждённое прогрессирование. Такой формат позволяет исследовать динамику заболевания, а не только отдельные медицинские записи.

Модули исследовательской ML-платформы

Прогрессирование заболевания

Структурирует клинические события вокруг конечных точек прогрессирования и поддерживает исследование риск-паттернов на заданных временных горизонтах.

Ответ на терапию

Исследует связь клинических показателей с риском отсутствия ответа или раннего прогрессирования на фоне текущей линии терапии.

Стратификация пациентов

Группирует когорты по общим клиническим признакам для исследовательского анализа риска раннего прогрессирования.

Данные визуализации

Признаки визуализации, связанные с клиническим и молекулярным контекстом. В планах развития; не входит в первый MVP.

Собственная прогностическая ML-система

M1

Временное моделирование

Анализирует последовательность клинических событий и оценивает риск прогрессирования на заданных временных горизонтах.

M2

Сравнительная валидация

Сопоставляет несколько прогностических подходов и выбирает конфигурацию с лучшей устойчивостью, калибровкой и переносимостью.

M3

Объяснимость и неопределённость

Показывает факторы, повлиявшие на результат, и сообщает, когда доступных данных недостаточно для уверенной оценки.

Источники данных

Первые модели обучены на открытых курируемых онкологических когортах

METABRIC

Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium — крупная курируемая когорта рака молочной железы с клинической и молекулярной разметкой.

TCGA-BRCA

The Cancer Genome Atlas, Breast Invasive Carcinoma — открытый мультиомиксный набор данных по раку молочной железы для перекрёстной проверки сигнала.

Получено через cBioPortal cbioportal.org

Эти открытые когорты западного происхождения. Они дают первичный сигнал; валидация на региональных популяциях пациентов — следующий шаг, и до неё региональная точность не заявляется.

Платформа

Продольная временная шкала

Сырые записи нормализуются в последовательность событий по каждому пациенту для исследовательского моделирования динамики прогрессирования и ответа на терапию.

Зоны риска на валидации

Низкая, средняя и высокая зоны на 3, 6 и 12 месяцев рассматриваются как исследовательский результат и требуют проверки перед пилотным использованием.

Объяснения через SHAP

Исследовательский вывод может включать факторы, такие как стадия, Ki-67, лимфоузлы и динамика маркеров, чтобы допущения можно было проверить.

Развёртывание с приоритетом приватности

Проектируется для деидентифицированных данных, локального или частного облачного развёртывания и контролируемого доступа к данным в исследовательских пилотах.

Оценка неопределённости

Интерфейс проектируется так, чтобы показывать неполноту данных, например отсутствие HER2 или свежего контрольного обследования.

Воспроизводимые пайплайны

Прослеживаемые допущения, версионированные эксперименты и журналирование исследовательских выводов поддерживают аудит на этапе разработки модели.

ОтчётКогортаДанные
СИНТЕТИЧЕСКИЙ_ПАЦИЕНТ · молочная железа · стадия III · Концепт

Концепт исследовательского отчёта по риску прогрессирования

КОНЦЕПТ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКОГО ОТЧЁТА · ГОРИЗОНТ: 12 мес · RESEARCH USE ONLY

3 МЕСЯЦАНизкий
6 МЕСЯЦЕВСредний
12 МЕСЯЦЕВВысокий

ИЛЛЮСТРАТИВНЫЕ ФАКТОРЫ · SHAP

Высокий Ki-67
Лимфоузлы (N2)
Рост онкомаркеров ↑
Подтип (HER2−)

ИЛЛЮСТРАТИВНЫЙ ВИД РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ концептуальная шкала

3612 mo
// ДЕМОНСТРАЦИОННЫЙ ИНТЕРФЕЙС. Значения и пациент синтетические. Модель проходит разработку и валидацию.

Принципы разработки Fantom BioLabs

ПринципСтатус
Объяснимый исследовательский выводSHAP-факторы и проверяемые допущения для каждого исследовательского отчёта
Встроено в дизайн
Неопределённость показывается явноНеполные данные должны быть видны, а не скрыты за ложной точностью
Встроено в дизайн
Работа с доступными клиническими даннымиNGS и ctDNA могут быть полезны, но не обязательны для концепта MVP
Объём MVP
Продольные клинические наборы данныхПроектируется для ретроспективных обезличенных историй лечения
В разработке
Приватность исследовательского процессаЛокальное или частное облачное развёртывание для контролируемых пилотов
Принцип дизайна
Сравнение с клиническим baselineОбязательная проверка перед пилотным использованием
Проверяется
Позиционирование Research Use OnlyНе для диагноза, изменения терапии или замены клинического решения
Обязательно

Почему мы создаём Fantom BioLabs

Команда Fantom BioLabs

В региональных онкологических центрах накапливаются годы клинических данных, но они редко используются для системного анализа динамики лечения. Наша задача — превратить обезличенные архивные истории в проверяемые прогностические модели, которые помогут исследователям и врачам лучше понимать риск прогрессирования и неопределённость результата.
Команда Fantom BioLabsRESEARCH USE ONLY

Запросить доступ

Мы работаем с исследовательскими и клиническими командами над ретроспективными пилотами, стратификацией пациентов и генерацией доказательств для исследовательского MVP.

Запросить доступ
Только для научного использования (Research Use Only). Fantom BioLabs — исследовательский инструмент поддержки принятия решений на стадии разработки. Он не ставит диагноз, не изменяет лечение и не заменяет врача. Его нельзя использовать для изменения терапии конкретного пациента до полноценной клинической валидации.