Аурудың үдеуі
Клиникалық оқиғаларды үдеу нүктелері айналасында құрылымдап, берілген уақыт көкжиектерінде қауіп үлгілерін зерттеуге көмектеседі.
Қатерлі ісіктің үдеу қаупін зерттеуге арналған түсіндірілетін ML-платформа
Қолжетімді клиникалық деректер негізінде 3, 6 және 12 айлық көкжиектерде үдеу қаупін бағалау және терапияға жауапты талдау үшін жасалып жатқан зерттеу жүйесі.
Қолжетімділік сұрауБойлық клиникалық деректермен жұмыс істеу үшін әзірленіп жатыр
Платформа пациенттің уақыттық жолын қалыптастырады: диагноз, терапия, бақылау тексерістері, жауап және расталған үдеу. Мұндай формат жеке медициналық жазбаларды ғана емес, ауру динамикасын зерттеуге мүмкіндік береді.
Зерттеуге арналған ML-платформа модульдері
Терапияға жауап
Клиникалық көрсеткіштердің ағымдағы терапия желісінде жауап болмау немесе ерте үдеу қаупімен байланысын зерттейді.
Пациенттерді стратификациялау
Ерте үдеу қаупін зерттеу үшін когорталарды ортақ клиникалық белгілер бойынша топтастырады.
Бейнелеу деректері
Клиникалық және молекулалық контекстпен байланыстырылатын бейнелеу белгілері. Даму жоспарында; алғашқы MVP құрамына кірмейді.
Меншікті прогностикалық ML-жүйе
M1
Уақыттық модельдеу
Клиникалық оқиғалардың ретін талдап, берілген уақыт көкжиектерінде үдеу қаупін бағалайды.
M2
Салыстырмалы валидация
Бірнеше прогностикалық тәсілді салыстырып, тұрақтылығы, калибрленуі және тасымалдануы жақсырақ конфигурацияны таңдайды.
M3
Түсіндірілім және белгісіздік
Нәтижеге әсер еткен факторларды көрсетеді және сенімді бағалау үшін деректер жеткіліксіз болған жағдайды хабарлайды.
Деректер көзі
Алғашқы модельдер ашық, курацияланған онкологиялық когорттарда оқытылған
METABRIC
Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium — клиникалық және молекулалық белгіленуі бар сүт безі қатерлі ісігінің үлкен курацияланған когортасы.
TCGA-BRCA
The Cancer Genome Atlas, Breast Invasive Carcinoma — сигналды когорттар арасында тексеруге арналған сүт безі қатерлі ісігі бойынша ашық мультиомикс деректер жиыны.
cBioPortal арқылы алынған cbioportal.org
Бұл ашық когорттар батыстық шыққан. Олар бастапқы сигнал береді; аймақтық пациент популяцияларында валидациялау — келесі қадам, оған дейін аймақтық дәлдік мәлімделмейді.
Платформа
Бойлық уақыт шкаласы
Бастапқы жазбалар әр пациент бойынша оқиғалар тізбегіне келтіріліп, үдеу мен терапияға жауап динамикасын зерттеуге негіз болады.
Валидациядағы қауіп аймақтары
3, 6 және 12 айға арналған төмен, орта және жоғары аймақтар зерттеу нәтижесі ретінде қаралады және пилоттық қолдануға дейін тексерілуі тиіс.
SHAP арқылы түсіндіру
Зерттеу қорытындысында саты, Ki-67, лимфа түйіндері және маркерлер динамикасы сияқты факторлар көрсетіліп, болжамдық жорамалдарды тексеруге мүмкіндік беріледі.
Құпиялық басымдығы бар орналастыру
Жүйе деидентификацияланған деректермен, жергілікті немесе жеке бұлтта орналастырумен және зерттеу пилоттарындағы бақыланатын қолжетімділікпен жұмыс істеуге жобаланады.
Белгісіздікті бағалау
Интерфейс HER2 статусының немесе жаңа бақылау тексерісінің болмауы сияқты деректер толық емес жағдайларды көрсетуге арналған.
Қайталанатын пайплайндар
Қадағаланатын жорамалдар, нұсқаланған эксперименттер және зерттеу қорытындыларын журналдау модель әзірлеу кезеңіндегі аудитті қолдайды.
ЕсепКогортаДеректер
СИНТЕТИКАЛЫҚ_ПАЦИЕНТ · сүт безі · III саты · КонцептҮдеу қаупі жөніндегі зерттеу есебінің концепті
3 АЙТөмен
6 АЙОрта
12 АЙЖоғары
Жоғары Ki-67
Лимфа түйіндері (N2)
Онкомаркерлердің өсуі ↑
Субтип (HER2−)
// ДЕМОНСТРАЦИЯЛЫҚ ИНТЕРФЕЙС. Мәндер мен пациент синтетикалық. Модель әзірлеу және валидация кезеңінен өтіп жатыр.
Fantom BioLabs әзірлеу қағидалары
ҚағидаСтатус
Түсіндірілетін зерттеу қорытындысыӘр зерттеу есебі үшін SHAP факторлары және тексерілетін жорамалдар
Дизайнға енгізілгенБелгісіздік ашық көрсетіледіТолық емес деректер жалған дәлдікпен бүркемеленбеуі керек
Дизайнға енгізілгенҚолжетімді клиникалық деректермен жұмысNGS және ctDNA пайдалы болуы мүмкін, бірақ MVP концепті үшін міндетті емес
MVP көлеміБойлық клиникалық деректер жиындарыРетроспективті деидентификацияланған емдеу тарихтарымен жұмыс істеуге жобаланады
Әзірленіп жатырЗерттеу процесіндегі құпиялықБақыланатын пилоттар үшін жергілікті немесе жеке бұлтта орналастыру
Дизайн қағидасыКлиникалық baseline-пен салыстыруПилоттық қолдануға дейінгі міндетті тексеру
ТексерілудеResearch Use Only позициясыДиагноз қоюға, терапияны өзгертуге немесе клиникалық шешімді алмастыруға арналмаған
МіндеттіFantom BioLabs не үшін жасалып жатыр
Fantom BioLabs командасы
“Аймақтық онкологиялық орталықтарда жылдар бойы клиникалық деректер жиналады, бірақ олар ем динамикасын жүйелі талдау үшін сирек пайдаланылады. Біздің міндетіміз — деидентификацияланған архивтік тарихтарды тексерілетін прогностикалық модельдерге айналдырып, зерттеушілер мен дәрігерлерге үдеу қаупін және нәтиженің белгісіздігін жақсырақ түсінуге көмектесу.”Fantom BioLabs командасыRESEARCH USE ONLY
Қолжетімділік сұрау
Біз зерттеу және клиникалық командалармен ретроспективті пилоттар, пациенттерді стратификациялау және зерттеу MVP үшін дәлел жинау бағытында жұмыс істейміз.
Қолжетімділік сұрауТек ғылыми-зерттеу мақсатында қолдануға арналған (Research Use Only). Fantom BioLabs — әзірлеу кезеңіндегі шешім қабылдауды қолдайтын зерттеу құралы. Ол диагноз қоймайды, емді өзгертпейді және дәрігерді алмастырмайды. Толық клиникалық валидацияға дейін оны нақты пациенттің терапиясын өзгерту үшін пайдалануға болмайды.